С 27 апреля по 2 мая в Новосибирском государственном университете проходила II Школа молодых ученых «Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул» и хакатон по биоинформатике LifeCode-2018.

На школе участники выступали с докладами о своих исследованиях, делились идеями и обсуждали дальнейшие перспективы работы. Каждый день проходили мастер-классы по структурной биоинформатике.

Участники узнали, как с помощью ядерно-магнитного резонанса узнать структуру белка, как подобрать действующее вещество для разработки лекарства, как эффектно визуализировать структуру молекулярной системы для публикации.

Турнир по биоинформатике LifeCode-2018 – мероприятие для начинающих исследователей, которые привыкли решать сложные задачи и искать нестандартные решения. Хакатон проходит в режиме онлайн: студенты со всей России собираются вместе и в течении двух суток ищут ответы на полученные вопросы.

В этом году в «научной битве» сражались около 30 студентов, объединившихся в 8 команд. Были команды, которые приехали уже в полном составе и представляли конкретные вузы, в то время как другие ребята заявились на хакатон лично и искали единомышленников для совместной работы непосредственно перед началом турнира.

В этом году участникам предложили 6 задач из различных актуальных научных направлений.

Отчёты команд

Вы можете посмотреть отчёт команды, щёлкнув по её номеру ниже:

1 2 3 4 5 6 7 8

Команда №1

Задача

Предсказание наиболее распространенных изоформ мРНК генов на основании данных из базы Intropolis.

Полный текст задачи

Участники

  • Кобченко Антон
  • Яковлев Данила
  • Семина Елизавета
Слайд: /

Команда №2

Задача

Поиск препаратов от вируса клещевого энцефалита среди лекарств от гепатита С.

Полный текст задачи

Участники

  • Кулакова Анна
  • Марьясина Софья
  • Пищенко Илья
  • Романов Роман
Слайд: /

Команда №3

Задача

Предсказание наиболее распространенных изоформ мРНК генов на основании данных из базы Intropolis.

Полный текст задачи

Участники

  • Долгих Владислав
  • Долгих Михаил
  • Литовка Никита
Слайд: /

Команда №4

Задача

Проанализировать структуры РНК (ДНК) и понять, чем определяется связывание NF-kB c ДНК.

Полный текст задачи

Участники

  • Панюшев Николай
  • Аюшеева Арюна
  • Козлова Анастасия
  • Волощенко Иван
  • Сонец Игнат
  • Юлмухаметов Захар
Слайд: /

Команда №5

Задача

Поиск препаратов от вируса клещевого энцефалита среди лекарств от гепатита С.

Полный текст задачи

Участники

  • Булгакова Елена
  • Вахрушева Анна
  • Кудрявцев Александр
  • Скакунова Ксения
  • Петрушин Иван
Слайд: /

Команда №6

Задача

Предложить способы автоматического выделения клеток (с кометами и без них) на фоне экспериментальных помех в микроскопических полях.

Автоматизировать оценку самого основного параметра - % флуоресценции в хвосте кометы, за 100% приняв общую флуоресценцию этой кометы.

Полный текст задачи

Участники

  • Григорьева Дарья
  • Огарков Антон
  • Шварцберг Юлия
  • Борисов Антон
  • Юдина Елизавета
Слайд: /

Команда №7

Задача

Создание 3D моделей амилоидных фибрилл.

Полный текст задачи

Участники

  • Бондарев Станислав
  • Норьев Яков
  • Попова Аделия
  • Радькова Зинаида
  • Шелудченков Антон
Слайд: /

Команда №8

Задача

Предсказание наиболее распространенных изоформ мРНК генов на основании данных из базы Intropolis.

Полный текст задачи

Участники

  • Замятин Александр
  • Конин Максим

В качестве отчёта команда представила сайт: lifecode.kerweb.ru.

Отзывы участников